MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae JM45 plasmid p2

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022083	AT	3	6	52	57	50 %	50 %	0 %	0 %	530633266
2	NC_022083	A	6	6	83	88	100 %	0 %	0 %	0 %	530633266
3	NC_022083	GCC	2	6	98	103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633266
4	NC_022083	CAA	2	6	143	148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633266
5	NC_022083	TAT	2	6	153	158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530633266
6	NC_022083	TCA	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633266
7	NC_022083	GGC	2	6	557	562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633267
8	NC_022083	TCA	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633267
9	NC_022083	GCC	2	6	755	760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633267
10	NC_022083	CAC	2	6	771	776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633267
11	NC_022083	TTTA	2	8	946	953	25 %	75 %	0 %	0 %	530633267
12	NC_022083	AGG	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530633267
13	NC_022083	CTT	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530633268
14	NC_022083	AC	3	6	1839	1844	50 %	0 %	0 %	50 %	530633268
15	NC_022083	GTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530633268
16	NC_022083	GAA	2	6	1947	1952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530633268
17	NC_022083	CCG	2	6	1996	2001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633268
18	NC_022083	AAC	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633268
19	NC_022083	ATG	2	6	2087	2092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633269
20	NC_022083	TGGAA	2	10	2093	2102	40 %	20 %	40 %	0 %	530633269
21	NC_022083	GCG	2	6	2200	2205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633269
22	NC_022083	ATG	2	6	2300	2305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633269
23	NC_022083	TGA	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633269
24	NC_022083	CCA	2	6	2459	2464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633270
25	NC_022083	CCGG	2	8	2478	2485	0 %	0 %	50 %	50 %	530633270
26	NC_022083	CTG	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633270
27	NC_022083	CAG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633270
28	NC_022083	CCT	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633270
29	NC_022083	T	6	6	2602	2607	0 %	100 %	0 %	0 %	530633270
30	NC_022083	CCA	2	6	2695	2700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633270
31	NC_022083	ACC	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633270
32	NC_022083	A	6	6	2900	2905	100 %	0 %	0 %	0 %	530633271
33	NC_022083	GCT	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633271
34	NC_022083	TGGATA	2	12	2972	2983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633271
35	NC_022083	GGA	2	6	3057	3062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530633271
36	NC_022083	T	6	6	3097	3102	0 %	100 %	0 %	0 %	530633272
37	NC_022083	CCA	2	6	3112	3117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633272
38	NC_022083	CGG	2	6	3119	3124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633272
39	NC_022083	TCC	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633272
40	NC_022083	CGCT	2	8	3233	3240	0 %	25 %	25 %	50 %	530633272
41	NC_022083	ACC	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633272
42	NC_022083	ATC	2	6	3251	3256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633272
43	NC_022083	ACC	2	6	3293	3298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633272
44	NC_022083	CA	3	6	3348	3353	50 %	0 %	0 %	50 %	530633272
45	NC_022083	TCG	2	6	3422	3427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633272
46	NC_022083	TCA	2	6	3462	3467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633272
47	NC_022083	CAC	2	6	3529	3534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633272
48	NC_022083	ATG	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633272
49	NC_022083	TCC	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633272
50	NC_022083	AATA	2	8	3601	3608	75 %	25 %	0 %	0 %	530633272
51	NC_022083	CCG	2	6	3684	3689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633273
52	NC_022083	CGG	2	6	3812	3817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633273
53	NC_022083	ACC	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633273
54	NC_022083	C	6	6	3975	3980	0 %	0 %	0 %	100 %	530633273
55	NC_022083	GCC	2	6	4034	4039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633273
56	NC_022083	AAT	2	6	4063	4068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530633273
57	NC_022083	CTCGTC	2	12	4081	4092	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	530633273
58	NC_022083	GCG	2	6	4113	4118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633273
59	NC_022083	CAG	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633273
60	NC_022083	CCA	2	6	4185	4190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633273
61	NC_022083	CCG	2	6	4221	4226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633273
62	NC_022083	CCG	2	6	4254	4259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633273
63	NC_022083	CAGC	2	8	4279	4286	25 %	0 %	25 %	50 %	530633273
64	NC_022083	ATC	3	9	4380	4388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633274
65	NC_022083	GCT	2	6	4397	4402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633274
66	NC_022083	GCT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633274
67	NC_022083	TCA	2	6	4532	4537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633274
68	NC_022083	CCT	2	6	4592	4597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633274
69	NC_022083	CGC	2	6	4613	4618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
70	NC_022083	CGG	2	6	4654	4659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633274
71	NC_022083	CGC	2	6	4695	4700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
72	NC_022083	CTGG	2	8	4716	4723	0 %	25 %	50 %	25 %	530633274
73	NC_022083	CG	3	6	4725	4730	0 %	0 %	50 %	50 %	530633274
74	NC_022083	AGC	2	6	4834	4839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
75	NC_022083	CAG	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
76	NC_022083	ATG	2	6	4918	4923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633274
77	NC_022083	ATG	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633274
78	NC_022083	GC	3	6	4970	4975	0 %	0 %	50 %	50 %	530633274
79	NC_022083	ACA	2	6	4985	4990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633274
80	NC_022083	TCT	2	6	4991	4996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530633274
81	NC_022083	GCC	3	9	5046	5054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
82	NC_022083	GCC	3	9	5176	5184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
83	NC_022083	CTG	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633274
84	NC_022083	CGC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
85	NC_022083	CAG	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
86	NC_022083	TTC	2	6	5314	5319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530633274
87	NC_022083	CAG	2	6	5382	5387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
88	NC_022083	ACC	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633274
89	NC_022083	TGG	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530633274
90	NC_022083	CTG	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633274
91	NC_022083	GCTG	2	8	5720	5727	0 %	25 %	50 %	25 %	530633274
92	NC_022083	AGC	2	6	5794	5799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
93	NC_022083	CAG	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
94	NC_022083	GCCC	2	8	5840	5847	0 %	0 %	25 %	75 %	530633274
95	NC_022083	GCA	2	6	5882	5887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
96	NC_022083	TAA	2	6	5890	5895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530633274
97	NC_022083	ACA	2	6	5959	5964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633274
98	NC_022083	C	7	7	5967	5973	0 %	0 %	0 %	100 %	530633274
99	NC_022083	GCC	2	6	6026	6031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
100	NC_022083	TTA	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530633274
101	NC_022083	CGC	2	6	6127	6132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
102	NC_022083	TCCG	2	8	6161	6168	0 %	25 %	25 %	50 %	530633274
103	NC_022083	CAGC	2	8	6243	6250	25 %	0 %	25 %	50 %	530633274
104	NC_022083	GGC	3	9	6407	6415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633275
105	NC_022083	GTG	2	6	6426	6431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530633275
106	NC_022083	GGA	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530633275
107	NC_022083	GGT	2	6	6671	6676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530633276
108	NC_022083	CCAG	2	8	6776	6783	25 %	0 %	25 %	50 %	530633276
109	NC_022083	AGG	2	6	7836	7841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530633277
110	NC_022083	AGA	2	6	7901	7906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530633277
111	NC_022083	A	7	7	7913	7919	100 %	0 %	0 %	0 %	530633277
112	NC_022083	ACCTTT	2	12	7940	7951	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530633277
113	NC_022083	ATTTT	2	10	8099	8108	20 %	80 %	0 %	0 %	530633278
114	NC_022083	CAA	2	6	8122	8127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633278
115	NC_022083	T	6	6	8317	8322	0 %	100 %	0 %	0 %	530633279
116	NC_022083	ACC	4	12	8488	8499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
117	NC_022083	T	7	7	8511	8517	0 %	100 %	0 %	0 %	530633279
118	NC_022083	T	7	7	8524	8530	0 %	100 %	0 %	0 %	530633279
119	NC_022083	TTC	2	6	8551	8556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530633279
120	NC_022083	GAT	2	6	8571	8576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633279
121	NC_022083	T	6	6	8653	8658	0 %	100 %	0 %	0 %	530633279
122	NC_022083	ATTC	2	8	8718	8725	25 %	50 %	0 %	25 %	530633279
123	NC_022083	ATTCTG	2	12	8764	8775	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	530633279
124	NC_022083	ATC	2	6	8851	8856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633279
125	NC_022083	TGCCTC	2	12	8863	8874	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	530633279
126	NC_022083	CAG	2	6	8901	8906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633279
127	NC_022083	CAGCT	2	10	8983	8992	20 %	20 %	20 %	40 %	530633279
128	NC_022083	GCG	2	6	9035	9040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633279
129	NC_022083	CTG	2	6	9049	9054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633279
130	NC_022083	TCC	2	6	9068	9073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633279
131	NC_022083	CTGTC	2	10	9133	9142	0 %	40 %	20 %	40 %	530633279
132	NC_022083	ACC	2	6	9178	9183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
133	NC_022083	CAA	2	6	9222	9227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633279
134	NC_022083	AC	3	6	9303	9308	50 %	0 %	0 %	50 %	530633279
135	NC_022083	CCA	2	6	9342	9347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
136	NC_022083	TGC	2	6	9386	9391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633279
137	NC_022083	CAC	2	6	9403	9408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
138	NC_022083	CAT	2	6	9514	9519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633279
139	NC_022083	ATC	2	6	9526	9531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633279
140	NC_022083	GCA	2	6	9549	9554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633279
141	NC_022083	CAGC	2	8	9606	9613	25 %	0 %	25 %	50 %	530633279
142	NC_022083	CGG	2	6	9624	9629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633279
143	NC_022083	GCAG	2	8	9689	9696	25 %	0 %	50 %	25 %	530633279
144	NC_022083	CCA	2	6	9731	9736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
145	NC_022083	ACC	2	6	9763	9768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
146	NC_022083	ACC	2	6	9772	9777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
147	NC_022083	CCG	2	6	9788	9793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633279
148	NC_022083	CGT	2	6	9844	9849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633279
149	NC_022083	GCCCG	2	10	9856	9865	0 %	0 %	40 %	60 %	530633279
150	NC_022083	ACC	3	9	9880	9888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
151	NC_022083	TGA	2	6	9889	9894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633279
152	NC_022083	ACC	2	6	9940	9945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
153	NC_022083	CCA	2	6	9986	9991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
154	NC_022083	GAA	2	6	10160	10165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530633280
155	NC_022083	GTTT	2	8	10196	10203	0 %	75 %	25 %	0 %	530633280
156	NC_022083	ATC	2	6	10221	10226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633280
157	NC_022083	GT	3	6	10272	10277	0 %	50 %	50 %	0 %	530633280
158	NC_022083	TGG	2	6	10292	10297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530633280
159	NC_022083	CGG	2	6	10438	10443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633280
160	NC_022083	ATCGT	2	10	10656	10665	20 %	40 %	20 %	20 %	530633280
161	NC_022083	CAG	2	6	10785	10790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633280
162	NC_022083	TCC	2	6	10822	10827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633280
163	NC_022083	CTC	2	6	10845	10850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633280
164	NC_022083	CCGAT	2	10	10903	10912	20 %	20 %	20 %	40 %	530633280
165	NC_022083	GAA	2	6	10953	10958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530633280
166	NC_022083	CTGA	2	8	10959	10966	25 %	25 %	25 %	25 %	530633280
167	NC_022083	TCC	2	6	11134	11139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633280
168	NC_022083	GTT	2	6	11162	11167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530633280
169	NC_022083	TGT	2	6	11252	11257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530633280
170	NC_022083	TCCA	2	8	11278	11285	25 %	25 %	0 %	50 %	530633280
171	NC_022083	CGG	2	6	11303	11308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633280
172	NC_022083	CAG	2	6	11358	11363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633280
173	NC_022083	TTCT	2	8	11385	11392	0 %	75 %	0 %	25 %	530633280
174	NC_022083	GCT	2	6	11396	11401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633280
175	NC_022083	TG	3	6	11465	11470	0 %	50 %	50 %	0 %	530633280
176	NC_022083	GTT	2	6	11529	11534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530633280
177	NC_022083	CGC	2	6	11544	11549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633280
178	NC_022083	TCTCC	2	10	11570	11579	0 %	40 %	0 %	60 %	530633280

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.